Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdc2P43407 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdc2P43407 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sdc2P43407 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms