Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Msh2P43247 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh2P43247 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Msh2P43247 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Msh2P43247 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Msh2P43247 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh2P43247 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh2P43247 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msh2P43247 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msh2P43247 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms