Protein–RNA interactions for Protein: P43243

MATR3, Matrin-3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATR3P43243 DBF4-203ENST00000430279 1274 ntTSL 214.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 32
MATR3P43243 DBF4-204ENST00000431138 2342 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 32
MATR3P43243 DBF4-207ENST00000498144 576 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 32
MATR3P43243 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.679e-9■■■■■ 31.9
MATR3P43243 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-216ENST00000479525 1368 ntTSL 519.05■□□□□ 0.648e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.71□□□□□ -1.348e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 26.64□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 55.66□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 55.39□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 54.16□□□□□ -1.748e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 53.74□□□□□ -1.818e-7■■■■■ 31.9
MATR3P43243 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 523.66■■□□□ 1.388e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 523.23■■□□□ 1.318e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-206ENST00000449900 580 ntTSL 321.9■■□□□ 1.18e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-210ENST00000460313 568 ntTSL 221.68■■□□□ 1.068e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.98e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 320.65■□□□□ 0.98e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-222ENST00000495967 554 ntTSL 420.33■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-221ENST00000495681 536 ntTSL 520.33■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-208ENST00000454854 469 ntTSL 420.33■□□□□ 0.858e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.788e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 319.77■□□□□ 0.768e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 219.61■□□□□ 0.738e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.678e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.628e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.498e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-207ENST00000453160 529 ntTSL 416.53■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.198e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 315.74■□□□□ 0.118e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.098e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.038e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 215.12■□□□□ 0.018e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SLC1A2-206ENST00000479543 564 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 31.8
MATR3P43243 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.128e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-203ENST00000341734 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 313.42□□□□□ -0.268e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-209ENST00000458594 2753 ntTSL 512.51□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 211.6□□□□□ -0.558e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 HLTF-202ENST00000392912 3896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.588e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASTN2-207ENST00000373986 3812 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.688e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.728e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-205ENST00000431535 873 ntTSL 510.23□□□□□ -0.778e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 510.19□□□□□ -0.788e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ASCC2-214ENST00000465667 876 ntTSL 39.92□□□□□ -0.828e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.848e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.898e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 HLTF-207ENST00000493881 461 ntTSL 47.91□□□□□ -1.148e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.178e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 MAMDC2-AS1-208ENST00000591368 1166 ntTSL 57.5□□□□□ -1.218e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 31.8
MATR3P43243 MRPS6-203ENST00000482679 1956 ntTSL 26.61□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.378e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.448e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 SLC1A2-207ENST00000531628 597 ntTSL 55.89□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.588e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ARID2-208ENST00000479608 7761 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.688e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 MRPS6-204ENST00000483977 3934 ntTSL 1 (best)4.49□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 31.8
MATR3P43243 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.818e-9■■■■■ 31.8
MATR3P43243 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 31.6
MATR3P43243 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.217e-7■■■■■ 31.6
MATR3P43243 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 31.4
MATR3P43243 POLE4-201ENST00000233699 602 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 31.4
MATR3P43243 POLE4-203ENST00000465242 528 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 31.4
MATR3P43243 CLASP2-223ENST00000496954 685 ntTSL 417.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 CLASP2-217ENST00000486796 656 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 CLASP2-215ENST00000482896 580 ntTSL 411.12□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 CLASP2-224ENST00000498331 452 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 31.3
MATR3P43243 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.315e-9■■■■■ 31.3
MATR3P43243 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 31.3
MATR3P43243 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.45e-9■■■■■ 31.3
MATR3P43243 TSC22D1-206ENST00000486464 1093 ntTSL 58.24□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 31.3
MATR3P43243 TSC22D1-204ENST00000460842 903 ntTSL 37.97□□□□□ -1.135e-9■■■■■ 31.3
MATR3P43243 NPLOC4-217ENST00000574897 2365 ntTSL 225.78■■□□□ 1.722e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 DMTF1-214ENST00000434534 581 ntTSL 417.29■□□□□ 0.363e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 UCHL3-203ENST00000471792 696 ntTSL 314.65□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 31.3
MATR3P43243 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 31.3
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