Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC45.52■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC45.52■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
NCAPD3P42695 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
NCAPD3P42695 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC45.42■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.41■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC45.4■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.38■■■■■ 4.86
NCAPD3P42695 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC45.32■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
NCAPD3P42695 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.32■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
NCAPD3P42695 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
NCAPD3P42695 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC45.21■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms