Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC19A1P41440 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC19A1P41440 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC19A1P41440 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms