Protein–RNA interactions for Protein: P41217

CD200, OX-2 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD200P41217 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CD200P41217 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CD200P41217 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD200P41217 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CD200P41217 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD200P41217 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CD200P41217 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CD200P41217 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CD200P41217 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD200P41217 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD200P41217 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD200P41217 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD200P41217 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD200P41217 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD200P41217 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD200P41217 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD200P41217 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD200P41217 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD200P41217 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD200P41217 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD200P41217 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD200P41217 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD200P41217 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD200P41217 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD200P41217 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD200P41217 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD200P41217 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD200P41217 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD200P41217 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD200P41217 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD200P41217 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD200P41217 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD200P41217 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD200P41217 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD200P41217 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD200P41217 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD200P41217 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD200P41217 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD200P41217 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD200P41217 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD200P41217 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD200P41217 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD200P41217 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD200P41217 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD200P41217 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD200P41217 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD200P41217 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD200P41217 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms