Protein–RNA interactions for Protein: P38187

UBP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, yeastyeast

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP13P38187 SPE4YLR146C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
UBP13P38187 RTC4YNL254C 1206 nt7.76□□□□□ -1.17
UBP13P38187 CMK2YOL016C 1344 nt7.76□□□□□ -1.17
UBP13P38187 GNA1YFL017C 480 nt7.75□□□□□ -1.17
UBP13P38187 MCP1YOR228C 909 nt7.75□□□□□ -1.17
UBP13P38187 DPM1YPR183W 804 nt7.74□□□□□ -1.17
UBP13P38187 snR30snR30 606 nt7.74□□□□□ -1.17
UBP13P38187 MPE1YKL059C 1326 nt7.74□□□□□ -1.17
UBP13P38187 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 PDA1YER178W 1263 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 YGL260WYGL260W 231 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 ZIM17YNL310C 525 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 CBK1YNL161W 2271 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 NAF1YNL124W 1479 nt7.73□□□□□ -1.17
UBP13P38187 FCP1YMR277W 2199 nt7.72□□□□□ -1.17
UBP13P38187 YKL147CYKL147C 618 nt7.72□□□□□ -1.17
UBP13P38187 GET4YOR164C 939 nt7.72□□□□□ -1.17
UBP13P38187 YPR130CYPR130C 408 nt7.72□□□□□ -1.17
UBP13P38187 RDR1YOR380W 1641 nt7.71□□□□□ -1.17
UBP13P38187 YLR030WYLR030W 792 nt7.71□□□□□ -1.18
UBP13P38187 AAD14YNL331C 1131 nt7.71□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YOR041CYOR041C 432 nt7.71□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YLR162WYLR162W 357 nt7.7□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YMR074CYMR074C 438 nt7.7□□□□□ -1.18
UBP13P38187 LGE1YPL055C 999 nt7.7□□□□□ -1.18
UBP13P38187 MAL31YBR298C 1845 nt7.69□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YJL144WYJL144W 315 nt7.69□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YKR018CYKR018C 2178 nt7.69□□□□□ -1.18
UBP13P38187 SML1YML058W 315 nt7.68□□□□□ -1.18
UBP13P38187 CDC7YDL017W 1524 nt7.68□□□□□ -1.18
UBP13P38187 GTS1YGL181W 1191 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YGR139WYGR139W 339 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YMR253CYMR253C 1245 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 RPL43AYPR043W 279 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 SPE3YPR069C 882 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YHR131CYHR131C 2553 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 ERR3YMR323W 1314 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 ERR1YOR393W 1314 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 ERR2YPL281C 1314 nt7.67□□□□□ -1.18
UBP13P38187 PLB2YMR006C 2121 nt7.66□□□□□ -1.18
UBP13P38187 CIA1YDR267C 993 nt7.66□□□□□ -1.18
UBP13P38187 LIP5YOR196C 1245 nt7.66□□□□□ -1.18
UBP13P38187 YCL049CYCL049C 939 nt7.66□□□□□ -1.18
UBP13P38187 MSS51YLR203C 1311 nt7.66□□□□□ -1.18
UBP13P38187 CDC23YHR166C 1881 nt7.64□□□□□ -1.19
UBP13P38187 DMC1YER179W 1005 nt7.64□□□□□ -1.19
UBP13P38187 ERG27YLR100W 1044 nt7.64□□□□□ -1.19
UBP13P38187 PGI1YBR196C 1665 nt7.63□□□□□ -1.19
UBP13P38187 PUS4YNL292W 1212 nt7.63□□□□□ -1.19
UBP13P38187 TOS2YGR221C 1869 nt7.63□□□□□ -1.19
UBP13P38187 AQR1YNL065W 1761 nt7.63□□□□□ -1.19
UBP13P38187 MLS1YNL117W 1665 nt7.63□□□□□ -1.19
UBP13P38187 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.62□□□□□ -1.19
UBP13P38187 HTZ1YOL012C 405 nt7.62□□□□□ -1.19
UBP13P38187 BRN1YBL097W 2265 nt7.61□□□□□ -1.19
UBP13P38187 PLB3YOL011W 2061 nt7.61□□□□□ -1.19
UBP13P38187 ACO1YLR304C 2337 nt7.6□□□□□ -1.19
UBP13P38187 ERG10YPL028W 1197 nt7.6□□□□□ -1.19
UBP13P38187 YPL041CYPL041C 624 nt7.6□□□□□ -1.19
UBP13P38187 SEC24YIL109C 2781 nt7.6□□□□□ -1.19
UBP13P38187 MHP1YJL042W 4197 nt7.6□□□□□ -1.19
UBP13P38187 YNR005CYNR005C 405 nt7.59□□□□□ -1.19
UBP13P38187 YOL046CYOL046C 675 nt7.59□□□□□ -1.19
UBP13P38187 MPH3YJR160C 1809 nt7.58□□□□□ -1.2
UBP13P38187 BIO3YNR058W 1443 nt7.58□□□□□ -1.2
UBP13P38187 NMD5YJR132W 3147 nt7.58□□□□□ -1.2
UBP13P38187 FLC2YAL053W 2352 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YJL163CYJL163C 1668 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 APE4YHR113W 1473 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 CAN1YEL063C 1773 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 MGM101YJR144W 810 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 SUN4YNL066W 1263 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YPR076WYPR076W 375 nt7.57□□□□□ -1.2
UBP13P38187 LDB7YBL006C 543 nt7.56□□□□□ -1.2
UBP13P38187 HSM3YBR272C 1443 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 PRB1YEL060C 1908 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YCR049CYCR049C 447 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YOL099CYOL099C 492 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 FIT2YOR382W 462 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 RMD8YFR048W 1989 nt7.55□□□□□ -1.2
UBP13P38187 EDC3YEL015W 1656 nt7.54□□□□□ -1.2
UBP13P38187 POB3YML069W 1659 nt7.54□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YER137CYER137C 447 nt7.54□□□□□ -1.2
UBP13P38187 NTG2YOL043C 1143 nt7.54□□□□□ -1.2
UBP13P38187 PHO85YPL031C 918 nt7.54□□□□□ -1.2
UBP13P38187 NUP57YGR119C 1626 nt7.53□□□□□ -1.2
UBP13P38187 THR1YHR025W 1074 nt7.53□□□□□ -1.2
UBP13P38187 YOR111WYOR111W 699 nt7.53□□□□□ -1.2
UBP13P38187 TOD6YBL054W 1578 nt7.53□□□□□ -1.2
UBP13P38187 ADE17YMR120C 1779 nt7.52□□□□□ -1.21
UBP13P38187 YAL045CYAL045C 309 nt7.52□□□□□ -1.21
UBP13P38187 EXG2YDR261C 1689 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 COX15YER141W 1461 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 HOC1YJR075W 1191 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 YPR127WYPR127W 1038 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 ICL2YPR006C 1728 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 ECM27YJR106W 2178 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 FCY2YER056C 1602 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 CYS4YGR155W 1524 nt7.51□□□□□ -1.21
UBP13P38187 PPH21YDL134C 1110 nt7.5□□□□□ -1.21
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