Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT2P35908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT2P35908 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT2P35908 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT2P35908 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT2P35908 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT2P35908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT2P35908 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT2P35908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT2P35908 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT2P35908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT2P35908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT2P35908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT2P35908 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT2P35908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT2P35908 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT2P35908 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT2P35908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT2P35908 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT2P35908 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT2P35908 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT2P35908 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT2P35908 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT2P35908 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT2P35908 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT2P35908 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT2P35908 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT2P35908 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT2P35908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT2P35908 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT2P35908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT2P35908 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT2P35908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT2P35908 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT2P35908 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT2P35908 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT2P35908 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT2P35908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT2P35908 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT2P35908 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT2P35908 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT2P35908 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT2P35908 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT2P35908 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT2P35908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT2P35908 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms