Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PtprkP35822 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprkP35822 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PtprkP35822 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PtprkP35822 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PtprkP35822 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprkP35822 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PtprkP35822 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PtprkP35822 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PtprkP35822 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprkP35822 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
PtprkP35822 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PtprkP35822 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PtprkP35822 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PtprkP35822 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PtprkP35822 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PtprkP35822 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprkP35822 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PtprkP35822 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms