Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptpn1P35821 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn1P35821 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn1P35821 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn1P35821 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpn1P35821 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.4 ms