Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT9P35527 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT9P35527 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT9P35527 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT9P35527 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT9P35527 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT9P35527 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT9P35527 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT9P35527 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT9P35527 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT9P35527 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT9P35527 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT9P35527 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT9P35527 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT9P35527 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT9P35527 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT9P35527 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT9P35527 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT9P35527 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT9P35527 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT9P35527 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT9P35527 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT9P35527 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT9P35527 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT9P35527 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT9P35527 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT9P35527 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT9P35527 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT9P35527 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT9P35527 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT9P35527 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT9P35527 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT9P35527 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT9P35527 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT9P35527 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT9P35527 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT9P35527 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT9P35527 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT9P35527 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT9P35527 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT9P35527 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT9P35527 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT9P35527 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT9P35527 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT9P35527 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT9P35527 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT9P35527 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT9P35527 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms