Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rab17P35292 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab17P35292 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab17P35292 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab17P35292 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab17P35292 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab17P35292 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab17P35292 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rab17P35292 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab17P35292 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms