Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab23P35288 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab23P35288 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab23P35288 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab23P35288 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab23P35288 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab23P35288 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab23P35288 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab23P35288 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab23P35288 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab23P35288 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab23P35288 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab23P35288 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab23P35288 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab23P35288 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab23P35288 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab23P35288 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms