Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA3P35244 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA3P35244 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPA3P35244 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPA3P35244 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA3P35244 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA3P35244 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA3P35244 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA3P35244 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA3P35244 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA3P35244 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA3P35244 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPA3P35244 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA3P35244 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPA3P35244 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPA3P35244 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPA3P35244 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPA3P35244 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPA3P35244 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPA3P35244 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPA3P35244 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA3P35244 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA3P35244 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPA3P35244 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA3P35244 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA3P35244 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA3P35244 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA3P35244 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA3P35244 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA3P35244 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA3P35244 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA3P35244 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA3P35244 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA3P35244 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA3P35244 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA3P35244 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA3P35244 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA3P35244 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA3P35244 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA3P35244 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms