Protein–RNA interactions for Protein: P35181

APS1, AP-1 complex subunit sigma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APS1P35181 HTS1YPR033C 1641 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 TDP1YBR223C 1635 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 YCR025CYCR025C 411 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 GTT3YEL017W 1014 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 PHO85YPL031C 918 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 YLL066CYLL066C 3618 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 STE3YKL178C 1413 nt5.46□□□□□ -1.54
APS1P35181 TOS2YGR221C 1869 nt5.45□□□□□ -1.54
APS1P35181 CCT3YJL014W 1605 nt5.45□□□□□ -1.54
APS1P35181 SGE1YPR198W 1632 nt5.45□□□□□ -1.54
APS1P35181 BDS1YOL164W 1941 nt5.45□□□□□ -1.54
APS1P35181 YPR127WYPR127W 1038 nt5.45□□□□□ -1.54
APS1P35181 MKK1YOR231W 1527 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 SER2YGR208W 930 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 PAU15YIR041W 375 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 INP54YOL065C 1155 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 LSP1YPL004C 1026 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 YBR232CYBR232C 360 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 ECM38YLR299W 1983 nt5.44□□□□□ -1.54
APS1P35181 CDC7YDL017W 1524 nt5.43□□□□□ -1.54
APS1P35181 GRH1YDR517W 1119 nt5.43□□□□□ -1.54
APS1P35181 OPI8YKR035C 642 nt5.43□□□□□ -1.54
APS1P35181 YBR226CYBR226C 411 nt5.43□□□□□ -1.54
APS1P35181 YGR210CYGR210C 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 YMR206WYMR206W 942 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 YPL108WYPL108W 507 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 GYP8YFL027C 1494 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 SKI2YLR398C 3864 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 GLN3YER040W 2193 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 YNL295WYNL295W 1575 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 YPR084WYPR084W 1371 nt5.42□□□□□ -1.54
APS1P35181 RDR1YOR380W 1641 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 NSE5YML023C 1671 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 HSP12YFL014W 330 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 COX16YJL003W 357 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 MIX17YMR002W 471 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 ATF1YOR377W 1578 nt5.41□□□□□ -1.54
APS1P35181 MRPL28YDR462W 444 nt5.4□□□□□ -1.54
APS1P35181 RRP46YGR095C 672 nt5.4□□□□□ -1.54
APS1P35181 YMR074CYMR074C 438 nt5.4□□□□□ -1.54
APS1P35181 YNR014WYNR014W 639 nt5.4□□□□□ -1.54
APS1P35181 POX1YGL205W 2247 nt5.4□□□□□ -1.55
APS1P35181 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.39□□□□□ -1.55
APS1P35181 CEM1YER061C 1329 nt5.39□□□□□ -1.55
APS1P35181 PHO3YBR092C 1404 nt5.39□□□□□ -1.55
APS1P35181 RRP43YCR035C 1185 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 YNL017CYNL017C 339 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 YPT10YBR264C 600 nt5.38□□□□□ -1.55
APS1P35181 PPH22YDL188C 1134 nt5.37□□□□□ -1.55
APS1P35181 RPL43AYPR043W 279 nt5.37□□□□□ -1.55
APS1P35181 YFR006WYFR006W 1608 nt5.37□□□□□ -1.55
APS1P35181 PGI1YBR196C 1665 nt5.37□□□□□ -1.55
APS1P35181 DLD1YDL174C 1764 nt5.37□□□□□ -1.55
APS1P35181 TGA1tA(UGC)A 73 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 IRC5YFR038W 2562 nt5.36□□□□□ -1.55
APS1P35181 FCY22YER060W-A 1593 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 NOG2YNR053C 1461 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 YER156CYER156C 1017 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 QCR6YFR033C 444 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 YNL200CYNL200C 741 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 CDC16YKL022C 2523 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 TKL2YBR117C 2046 nt5.35□□□□□ -1.55
APS1P35181 ATP2YJR121W 1536 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 MSG5YNL053W 1470 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 DSC3YOR223W 879 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 RPS6AYPL090C 711 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 RPS6BYBR181C 711 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 SLA2YNL243W 2907 nt5.34□□□□□ -1.55
APS1P35181 KNS1YLL019C 2214 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 GDA1YEL042W 1557 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 YBL070CYBL070C 321 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 FCY1YPR062W 477 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 YLL058WYLL058W 1728 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 ATG22YCL038C 1587 nt5.33□□□□□ -1.56
APS1P35181 SPS22YCL048W 1392 nt5.32□□□□□ -1.56
APS1P35181 RAD51YER095W 1203 nt5.32□□□□□ -1.56
APS1P35181 THR1YHR025W 1074 nt5.32□□□□□ -1.56
APS1P35181 YOL099CYOL099C 492 nt5.32□□□□□ -1.56
APS1P35181 RPL5YPL131W 894 nt5.32□□□□□ -1.56
APS1P35181 ISC1YER019W 1434 nt5.31□□□□□ -1.56
APS1P35181 YUR1YJL139C 1287 nt5.31□□□□□ -1.56
APS1P35181 YJL144WYJL144W 315 nt5.31□□□□□ -1.56
APS1P35181 SPS1YDR523C 1473 nt5.31□□□□□ -1.56
APS1P35181 YFL052WYFL052W 1398 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 VMA2YBR127C 1554 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 CEF1YMR213W 1773 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 ERG27YLR100W 1044 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 CUE4YML101C 354 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 YPL041CYPL041C 624 nt5.3□□□□□ -1.56
APS1P35181 PAC2YER007W 1557 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.8 ms