Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP2P32456 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP2P32456 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP2P32456 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP2P32456 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP2P32456 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP2P32456 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP2P32456 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP2P32456 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP2P32456 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP2P32456 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP2P32456 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP2P32456 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP2P32456 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP2P32456 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP2P32456 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP2P32456 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP2P32456 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP2P32456 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP2P32456 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP2P32456 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP2P32456 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GBP2P32456 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GBP2P32456 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP2P32456 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP2P32456 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP2P32456 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP2P32456 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP2P32456 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP2P32456 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP2P32456 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP2P32456 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP2P32456 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP2P32456 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP2P32456 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP2P32456 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP2P32456 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP2P32456 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP2P32456 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP2P32456 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP2P32456 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP2P32456 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP2P32456 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP2P32456 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms