Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
BRS3P32247 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BRS3P32247 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRS3P32247 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRS3P32247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRS3P32247 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRS3P32247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRS3P32247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRS3P32247 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRS3P32247 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRS3P32247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRS3P32247 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRS3P32247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRS3P32247 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRS3P32247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BRS3P32247 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BRS3P32247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BRS3P32247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRS3P32247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRS3P32247 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRS3P32247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRS3P32247 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRS3P32247 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRS3P32247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRS3P32247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRS3P32247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRS3P32247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRS3P32247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRS3P32247 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRS3P32247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRS3P32247 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRS3P32247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRS3P32247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRS3P32247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRS3P32247 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRS3P32247 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRS3P32247 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRS3P32247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms