Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASQ1P31415 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CASQ1P31415 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CASQ1P31415 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASQ1P31415 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASQ1P31415 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
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