Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxc11P31313 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxc11P31313 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc11P31313 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms