Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXA7P31268 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HOXA7P31268 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXA7P31268 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXA7P31268 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXA7P31268 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms