Protein–RNA interactions for Protein: P31025

LCN1, Lipocalin-1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P31025 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P31025 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P31025 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCN1P31025 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P31025 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P31025 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P31025 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCN1P31025 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P31025 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P31025 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCN1P31025 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCN1P31025 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P31025 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P31025 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P31025 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P31025 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P31025 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P31025 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LCN1P31025 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P31025 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P31025 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P31025 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P31025 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LCN1P31025 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LCN1P31025 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LCN1P31025 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCN1P31025 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LCN1P31025 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P31025 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P31025 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LCN1P31025 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P31025 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P31025 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P31025 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LCN1P31025 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LCN1P31025 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCN1P31025 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P31025 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCN1P31025 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCN1P31025 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P31025 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P31025 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P31025 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCN1P31025 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCN1P31025 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms