Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX3P30048 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX3P30048 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDX3P30048 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX3P30048 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms