Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRDX6P30041 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDX6P30041 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDX6P30041 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDX6P30041 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDX6P30041 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms