Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Cnga1P29974 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cnga1P29974 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cnga1P29974 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Cnga1P29974 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Cnga1P29974 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cnga1P29974 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms