Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E2P29084 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2E2P29084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E2P29084 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2E2P29084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms