Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kif5cP28738 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kif5cP28738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kif5cP28738 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kif5cP28738 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms