Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nckap1P28660 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nckap1P28660 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nckap1P28660 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nckap1P28660 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nckap1P28660 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms