Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALRP27797 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALRP27797 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALRP27797 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALRP27797 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALRP27797 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALRP27797 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALRP27797 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALRP27797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALRP27797 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALRP27797 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALRP27797 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALRP27797 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALRP27797 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALRP27797 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALRP27797 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALRP27797 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALRP27797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALRP27797 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALRP27797 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALRP27797 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALRP27797 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALRP27797 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALRP27797 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALRP27797 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALRP27797 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALRP27797 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALRP27797 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALRP27797 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALRP27797 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALRP27797 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALRP27797 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALRP27797 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALRP27797 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALRP27797 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALRP27797 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALRP27797 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALRP27797 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALRP27797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALRP27797 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALRP27797 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALRP27797 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALRP27797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALRP27797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALRP27797 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALRP27797 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALRP27797 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALRP27797 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALRP27797 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALRP27797 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALRP27797 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALRP27797 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALRP27797 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALRP27797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms