Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD27P26842 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD27P26842 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD27P26842 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD27P26842 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD27P26842 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD27P26842 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD27P26842 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD27P26842 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CD27P26842 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD27P26842 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD27P26842 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD27P26842 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD27P26842 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD27P26842 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD27P26842 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD27P26842 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD27P26842 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD27P26842 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD27P26842 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD27P26842 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD27P26842 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD27P26842 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD27P26842 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD27P26842 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD27P26842 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD27P26842 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD27P26842 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD27P26842 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD27P26842 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD27P26842 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD27P26842 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD27P26842 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD27P26842 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD27P26842 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD27P26842 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD27P26842 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD27P26842 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD27P26842 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD27P26842 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD27P26842 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD27P26842 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD27P26842 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD27P26842 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD27P26842 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD27P26842 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD27P26842 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD27P26842 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD27P26842 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD27P26842 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD27P26842 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD27P26842 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD27P26842 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD27P26842 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD27P26842 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD27P26842 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD27P26842 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD27P26842 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD27P26842 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD27P26842 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD27P26842 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD27P26842 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD27P26842 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD27P26842 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD27P26842 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD27P26842 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD27P26842 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD27P26842 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms