Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DNMT1P26358 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DNMT1P26358 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
DNMT1P26358 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
DNMT1P26358 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DNMT1P26358 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DNMT1P26358 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms