Protein–RNA interactions for Protein: P26012

ITGB8, Integrin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB8P26012 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB8P26012 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITGB8P26012 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB8P26012 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB8P26012 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB8P26012 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB8P26012 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB8P26012 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB8P26012 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB8P26012 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB8P26012 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB8P26012 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB8P26012 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB8P26012 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB8P26012 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB8P26012 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms