Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMA1P25786 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMA1P25786 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMA1P25786 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMA1P25786 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMA1P25786 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms