Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccnd1P25322 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnd1P25322 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccnd1P25322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccnd1P25322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms