Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCM3P25205 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCM3P25205 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCM3P25205 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCM3P25205 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM3P25205 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM3P25205 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCM3P25205 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3P25205 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3P25205 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3P25205 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3P25205 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3P25205 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3P25205 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3P25205 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3P25205 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3P25205 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCM3P25205 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MCM3P25205 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3P25205 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3P25205 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3P25205 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3P25205 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3P25205 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3P25205 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3P25205 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3P25205 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3P25205 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3P25205 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3P25205 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3P25205 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3P25205 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3P25205 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MCM3P25205 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3P25205 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3P25205 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3P25205 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3P25205 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3P25205 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3P25205 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3P25205 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3P25205 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3P25205 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3P25205 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3P25205 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3P25205 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCM3P25205 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3P25205 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3P25205 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3P25205 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCM3P25205 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3P25205 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3P25205 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3P25205 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3P25205 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCM3P25205 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCM3P25205 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCM3P25205 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM3P25205 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM3P25205 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCM3P25205 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCM3P25205 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCM3P25205 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms