Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gria1P23818 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria1P23818 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria1P23818 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria1P23818 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria1P23818 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gria1P23818 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gria1P23818 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gria1P23818 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms