Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Mdm2P23804 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Mdm2P23804 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Mdm2P23804 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mdm2P23804 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Mdm2P23804 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdm2P23804 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdm2P23804 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdm2P23804 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Mdm2P23804 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms