Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRBP23467 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRBP23467 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRBP23467 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRBP23467 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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