Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GCSHP23434 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GCSHP23434 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCSHP23434 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GCSHP23434 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GCSHP23434 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GCSHP23434 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCSHP23434 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCSHP23434 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCSHP23434 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCSHP23434 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCSHP23434 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCSHP23434 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCSHP23434 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCSHP23434 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCSHP23434 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GCSHP23434 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCSHP23434 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCSHP23434 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GCSHP23434 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GCSHP23434 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCSHP23434 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCSHP23434 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GCSHP23434 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCSHP23434 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCSHP23434 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCSHP23434 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCSHP23434 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GCSHP23434 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GCSHP23434 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GCSHP23434 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GCSHP23434 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms