Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPAP23025 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPAP23025 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XPAP23025 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XPAP23025 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPAP23025 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPAP23025 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XPAP23025 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XPAP23025 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XPAP23025 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPAP23025 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPAP23025 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPAP23025 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XPAP23025 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPAP23025 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPAP23025 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPAP23025 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XPAP23025 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPAP23025 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPAP23025 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XPAP23025 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPAP23025 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XPAP23025 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPAP23025 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XPAP23025 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPAP23025 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPAP23025 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XPAP23025 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPAP23025 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPAP23025 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPAP23025 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XPAP23025 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XPAP23025 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPAP23025 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPAP23025 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XPAP23025 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XPAP23025 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPAP23025 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPAP23025 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPAP23025 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XPAP23025 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XPAP23025 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPAP23025 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPAP23025 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPAP23025 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPAP23025 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XPAP23025 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPAP23025 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
XPAP23025 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XPAP23025 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPAP23025 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPAP23025 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XPAP23025 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPAP23025 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPAP23025 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XPAP23025 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XPAP23025 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPAP23025 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XPAP23025 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPAP23025 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPAP23025 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPAP23025 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPAP23025 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPAP23025 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPAP23025 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPAP23025 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPAP23025 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPAP23025 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPAP23025 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPAP23025 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
XPAP23025 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPAP23025 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XPAP23025 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
XPAP23025 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms