Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Myo5bP21271 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Myo5bP21271 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Myo5bP21271 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Myo5bP21271 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo5bP21271 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms