Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tpm3P21107 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpm3P21107 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tpm3P21107 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpm3P21107 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms