Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCP20941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCP20941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCP20941 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDCP20941 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCP20941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCP20941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDCP20941 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCP20941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCP20941 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCP20941 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCP20941 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDCP20941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDCP20941 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PDCP20941 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCP20941 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCP20941 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PDCP20941 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCP20941 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCP20941 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCP20941 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PDCP20941 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCP20941 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCP20941 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCP20941 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PDCP20941 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCP20941 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCP20941 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCP20941 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PDCP20941 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCP20941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCP20941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCP20941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDCP20941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDCP20941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDCP20941 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCP20941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCP20941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCP20941 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCP20941 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDCP20941 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCP20941 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCP20941 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCP20941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCP20941 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDCP20941 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCP20941 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCP20941 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDCP20941 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCP20941 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PDCP20941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCP20941 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCP20941 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCP20941 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDCP20941 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDCP20941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCP20941 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDCP20941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCP20941 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCP20941 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCP20941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDCP20941 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCP20941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCP20941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCP20941 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDCP20941 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDCP20941 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDCP20941 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDCP20941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCP20941 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCP20941 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDCP20941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCP20941 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDCP20941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCP20941 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCP20941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDCP20941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCP20941 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDCP20941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDCP20941 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCP20941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCP20941 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDCP20941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDCP20941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms