Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EFNA1P20827 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EFNA1P20827 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EFNA1P20827 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EFNA1P20827 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms