Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChrneP20782 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChrneP20782 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChrneP20782 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChrneP20782 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChrneP20782 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChrneP20782 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ChrneP20782 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChrneP20782 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChrneP20782 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChrneP20782 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChrneP20782 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChrneP20782 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChrneP20782 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChrneP20782 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChrneP20782 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChrneP20782 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChrneP20782 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChrneP20782 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChrneP20782 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChrneP20782 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChrneP20782 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChrneP20782 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChrneP20782 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChrneP20782 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ChrneP20782 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChrneP20782 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ChrneP20782 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms