Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou5f1P20263 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pou5f1P20263 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou5f1P20263 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pou5f1P20263 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou5f1P20263 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms