Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN2P20062 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN2P20062 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN2P20062 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN2P20062 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN2P20062 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN2P20062 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN2P20062 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN2P20062 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCN2P20062 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCN2P20062 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCN2P20062 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN2P20062 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCN2P20062 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN2P20062 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN2P20062 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCN2P20062 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TCN2P20062 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCN2P20062 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCN2P20062 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCN2P20062 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCN2P20062 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN2P20062 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN2P20062 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN2P20062 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCN2P20062 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCN2P20062 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCN2P20062 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN2P20062 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN2P20062 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN2P20062 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN2P20062 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCN2P20062 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCN2P20062 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN2P20062 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN2P20062 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN2P20062 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN2P20062 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCN2P20062 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN2P20062 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN2P20062 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCN2P20062 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms