Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P20040 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P20040 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P20040 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P20040 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P20040 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P20040 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P20040 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P20040 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P20040 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P20040 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P20040 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P20040 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P20040 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P20040 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P20040 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P20040 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
P20040 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P20040 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P20040 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P20040 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P20040 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P20040 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P20040 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P20040 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P20040 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms