Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox5bP19536 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cox5bP19536 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cox5bP19536 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cox5bP19536 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cox5bP19536 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cox5bP19536 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cox5bP19536 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cox5bP19536 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cox5bP19536 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cox5bP19536 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cox5bP19536 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cox5bP19536 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cox5bP19536 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cox5bP19536 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cox5bP19536 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cox5bP19536 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms