Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ERCC3P19447 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC3P19447 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ERCC3P19447 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ERCC3P19447 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms