Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NefhP19246 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NefhP19246 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefhP19246 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefhP19246 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NefhP19246 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NefhP19246 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefhP19246 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NefhP19246 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NefhP19246 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefhP19246 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefhP19246 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NefhP19246 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NefhP19246 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefhP19246 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NefhP19246 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefhP19246 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefhP19246 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NefhP19246 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefhP19246 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NefhP19246 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NefhP19246 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefhP19246 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NefhP19246 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefhP19246 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NefhP19246 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NefhP19246 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefhP19246 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NefhP19246 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NefhP19246 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefhP19246 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefhP19246 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NefhP19246 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NefhP19246 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefhP19246 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NefhP19246 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefhP19246 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NefhP19246 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefhP19246 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefhP19246 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefhP19246 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NefhP19246 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefhP19246 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefhP19246 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefhP19246 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefhP19246 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NefhP19246 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NefhP19246 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefhP19246 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefhP19246 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NefhP19246 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NefhP19246 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NefhP19246 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NefhP19246 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NefhP19246 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefhP19246 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefhP19246 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefhP19246 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NefhP19246 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefhP19246 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefhP19246 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NefhP19246 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefhP19246 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NefhP19246 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefhP19246 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NefhP19246 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms